表观遗传钟已被视为评估衰老的有力工具。然而，它们应用中的一个主要缺点是我们缺乏对机械原理的理解。我们假设，由于表观遗传时钟是多因素的复合物，因此很难揭示潜在的生物学特性：它们由不同的部分组成，每个部分都有自己的因果机制和功能后果。因此，只有通过解构表观遗传时钟信号，才有可能收集生物学见解。在这里，我们使用多组织和体外数据集将5717个时钟CpG聚集成12个不同的模块。我们表明，表观遗传时钟由不同比例的模块组成，这可能解释了在给定研究中同时应用时它们的不一致性。我们还观察到，表观遗传重编程不会重置整个时钟，相反，观察到的再生是由一部分模块驱动的。总的来说，两个模块以其独特的功能而脱颖而出。第一种是对表观遗传重编程最敏感的基因之一；是全因死亡率的最强预测因子；随着离体传代时间的延长，衰老负担开始显现。第二光模块对重新编程有适度的响应；与正常组织相比，在肿瘤中速度非常快；即使在种群倍增速度减慢的情况下，也会在体外进行传代。总的来说，我们表明时钟解构可以识别独特的DNAm改变，并促进我们对表观遗传时钟的机械理解。