尖峰突变管道显示出现更具传播性的形式/

我们已经开发了一条分析管道，以便于实时跟踪SARS-CoV-2中的突变，最初专注于Spike(S)蛋白，因为它介导人类细胞的感染，是大多数疫苗策略和基于抗体的治疗的目标。到目前为止，我们已经在Spike中鉴定出14个正在积累的突变。突变在更广泛的系统发育背景下、地理上和随着时间的推移被考虑，以提供一个早期预警系统，以揭示可能在传播或抵抗干预方面具有选择性优势的突变。每一个基因都被评估为正选择的证据，并通过结构建模来探索突变的含义。突变Spike D614G令人迫切关注；在2月初开始在欧洲传播后，当它被引入新的地区时，它会反复而迅速地成为主导形式。此外，我们还提供了局部流行菌株之间重组的证据，这表明存在多个菌株感染。这些发现对SARS-CoV-2的传播、发病机制和免疫干预具有重要意义。