来自纽约市的旅行播下了美国疫情爆发的种子
一项新的研究显示，到3月初，纽约市的冠状病毒爆发规模变得如此之大，以至于该市成为美国新感染病毒的主要来源，数千名感染者从该市赶来，在全国各地播下了疫情的种子。
研究表明，在纽约市开始设定社会距离限制以阻止增长之前，一波感染浪潮从纽约市席卷了全国大部分地区。这助长了路易斯安那州、德克萨斯州、亚利桑那州以及远至西海岸的疫情爆发。
这些发现来自遗传学家追踪病毒的标志性变异、感染者的旅行史和传染病专家的疫情模型。
耶鲁大学公共卫生学院(Yale School Of Public Health)流行病学家内森·格鲁博(Nathan Grubaugh)说，“我们现在有足够的数据，可以相当有信心地认为，纽约是通往美国其他地区的主要门户。”
对基因样本的早期分析表明，全国范围内更多的感染来自与纽约市疫情有关的一系列病毒(用红色显示)，而不是来自与华盛顿州疫情有关的一系列病毒(用黄色显示)。
但即使在西海岸，与纽约相关的样本现在也更常见。
来自路易斯安那州的每个样本都与纽约有关，路易斯安那州是病毒的热点。
对基因样本的早期分析表明，全国范围内更多的感染来自与纽约市疫情有关的一系列病毒(用红色显示)，而不是来自与华盛顿州疫情有关的一系列病毒(用黄色显示)。
但即使在西海岸，与纽约相关的样本现在也更常见。
来自路易斯安那州的每个样本都与纽约有关，路易斯安那州是病毒的热点。
注：到目前为止，科学家只对总感染中的一小部分进行了测序，因此随着分析更多的样本，遗传系的分布可能会发生变化。样本少于10个的州被排除在图表之外。佐治亚州、伊利诺伊州、马里兰州、马萨诸塞州、新泽西州、俄勒冈州和怀俄明州的样本都不到20个。百分比之和可能不等于100，因为省略了额外的遗传系。
纽约疫情的核心作用表明，州和联邦官员做出的决定-包括等待实施疏远措施和限制国际航班-帮助塑造了疫情的发展轨迹，并使其在美国其他地区得以蔓延。
这座城市加入了世界上其他人口稠密的城市热点地区的行列，首先是中国武汉，然后是米兰，这些城市已经成为病毒传播的媒介。
研究人员说，来自美国其他城市的旅行也在全国范围内引发了感染，包括以西雅图地区为中心的早期疫情，在十几个州播下了感染的种子。他们说，即使纽约设法减缓了病毒的传播速度，它也可能会继续从其他地方传播。
但事实证明，西雅图疫情在纽约更大规模的风暴聚集之前是一场狂风，2月底，数千名感染者挤满了火车和餐馆，挤满了旅游景点，并通过了纽约的三个主要机场。
在3月份关键的几周里，纽约的政治领导人等待采取积极行动，即使在确认了数百例病例后，也让病毒抢占了先机。数据显示，到3月中旬，当特朗普总统限制来自欧洲的旅行时，这些限制基本上是没有意义的，因为这种疾病已经在美国境内广泛传播。
研究人员说，及早采取行动很可能会阻碍病毒在全国范围内的传播。
斯克里普斯研究公司(Scripps Research)免疫学和微生物系教授克里斯蒂安·安德森(Kristian Andersen)说，“这意味着我们很早就错过了机会，这个国家的绝大多数病毒都来自国内传播。”“我一直听人说这是别人的错。那是胡说。这不是别人的错，是我们自己的错。“。
几个月来，缺乏检测掩盖了疫情的真实程度，官员们根据不完整、有时相互矛盾的信息采取了行动。纽约疫情的巨大增长在一定程度上反映了它的国际游客数量，特别是来自欧洲的游客，因为大多数感染来自欧洲。
州长安德鲁·M·科莫(Andrew M.Cuomo)的公关主管丹尼·利弗(Dani Lever)批评了联邦当局，称“联邦政府在离开纽约和东海岸时，没有接触到来自欧洲的航班，同时告诉纽约州，我们整个2月都没有发现Covid病例，从而灌输了一种错误的安全感。”
白宫发言人贾德·迪尔(Judd Deere)表示，特朗普行动迅速。总统从3月13日开始阻止大多数来自欧洲的游客，一个多月前，他限制了来自中国的旅行。
迪尔说，“就在特朗普总统很早就采取行动切断病毒源头的时候，他的健康和传染病专家建议他应该切断来自欧洲的旅行--当民主党人和媒体批评他和全球卫生界仍然没有完全理解病毒的传播或传播水平时，他立即采取了果断行动来拯救生命，”迪尔说，“就像他很早就采取行动切断了从病毒源头出发的旅行一样，他的健康和传染病专家建议他应该切断来自欧洲的旅行--他毫不迟疑地采取了这一行动，以拯救生命。”
研究人员说，现在感染分散在全国各地，从纽约来的旅行不再是影响疫情进展的主要因素。
随着全国各州开始放松限制，调查结果表明，要阻止这些行动影响到全国其他地区，即使不是不可能，也是困难的。
遗传学家已经分析并分享了2000多份来自感染者的病毒样本。当病毒感染新的人并进行复制时，它会在此过程中获得突变。这些变异通常不会改变病毒的行为，但它们可以提供病毒起源的特征。
在德克萨斯州、俄亥俄州、路易斯安那州、爱达荷州、威斯康星州和其他许多州采集的大多数样本都带有明显的突变，这些突变可以追溯到引入纽约的病毒。
格鲁博博士估计，总体而言，从纽约传播的病毒占全国已确认感染病例的60%到65%。
其他科学家表示，在计算精确数字之前，他们希望看到更多的样本。但他们一致认为，纽约在播种全国价差方面的突出地位似乎始于3月初，也就是在全职订单到位之前两周。
亚利桑那州翻译基因组研究所(Translational Genology Research Institute)传染病分会负责人戴维·恩格尔塔勒(David Engelthaler)说，“纽约充当了这种病毒的中央车站，有机会从那里向如此多的方向、向如此多的地方传播。”
最常检测到的与纽约有关的病毒有一个独特的基因特征，将它们与欧洲的疫情联系在一起。那些从华盛顿州传播的人有一个签名，将他们直接与中国联系起来。
科学家说，在这个阶段，仅靠基因指纹不足以确定病毒的来源。但他们说，旅行模式和早期已知病例的病历支持这一想法。
“然而，这是基因组流行病学和鞋皮流行病学将告诉我们的内容的结合，”恩格尔特勒博士说。
在全国范围内模拟疾病发展的科学家们表示，纽约作为全国中心的突出地位与他们的发现大致一致，尽管情况仍在浮现。
波士顿东北大学网络科学研究所所长亚历山德罗·维斯皮尼亚尼(Alessandro Vespignani)说，“我想说，从某种意义上说，这并不令人惊讶。”“浮现的图景与数字模型一致。”
Vespignani博士早些时候的研究表明，疫情在纽约爆发得有多快，而且看不见。他的研究小组显示，到3月1日，当纽约确认第一例冠状病毒病例时，该市可能有超过1万例未检测到的感染。
纽约州和华盛顿州并不是唯一的疫情来源。科学家们认为，其他大型的国内枢纽也促成了这种传播，在全国各地的一些地方，特别是在中西部和南部的部分地区，仍然可以看到更多样化的基因组合。
遗传学家说，尽管国内旅行开始推动疫情的爆发，但一些感染仍然是由国际旅行者在全国各地传播的。专家表示，一些被认为来自纽约的病毒样本可能是通过从欧洲直飞的航班在其他城市传播的，或者是从其他地方旅行之前在纽约停留的旅行者身上传播的。
出于这个原因，一些科学家表示，在将美国的大多数感染与纽约联系起来之前，他们希望看到更多的样本。
纽约西奈山的遗传学家哈姆·范·巴克尔(Harm Van Bakel)说：“我认为这可能是即将出现的故事情节，但我希望看到更多的数据。”
专家说，“纽约时报”对旅行数据的分析支持这样一种观点，即感染链起源于纽约。根据数据情报公司Cuebiq的匿名手机跟踪数据，全国各地的病例数量与3月初每个地方从纽约收到的游客数量密切相关。
位于冰岛雷克雅未克的领先基因组分析公司deCODE Genetics的创始人兼首席执行官卡里·斯特凡森(Kari Stefansson)博士说，“看起来国内传播的基本上都是从纽约来的人。”
上周，斯克里普斯研究公司(Scripps Research)的安德森博士和其他分析新奥尔良疫情的科学家报告称，从新奥尔良提取的所有样本都来自与纽约有关联的那条线路。这种病毒在3月份席卷了该地区，已导致1000多人死亡。
格鲁博博士说，“你可以从旅行模式中找出，最有可能发生的事情是那些直接从纽约进入新奥尔良的人。”