生物遗传会议可能导致波士顿地区20,000例新冠肺炎病例
据参与一项新研究的三名科学家称，今年2月在波士顿一家酒店举行的生物遗传领袖国际会议导致，截至5月初，马萨诸塞州四个县出现了大约20,000例新冠肺炎病例，远远超过之前确认的99例。
研究人员检查了该地区几乎所有确诊的早期病例，这些病例是由于冠状病毒在从一个人传给另一个人的过程中基因构成发生了变化，研究人员得以评估了万豪长码头酒店“超级传播事件”的更广泛影响。
研究人员发现，使这一估计更加令人震惊的是，这种版本的病毒是1月底至5月初入侵该州的80多种病毒之一。但它引发了一场病毒性的森林大火。
这份长达64页的研究报告尚未发表，研究人员强调，他们的估计-没有出现在论文中，但他们在采访中分享了-是基于从772名当地患者分离出的病毒做出的推断。但他们相信他们的计算是合理的。
马萨诸塞州总医院(Massachusetts General Hospital)的传染病内科医生雅各布·莱米厄(Jacob Lemieux)博士说，“我相信，衡量这一事件的尺度有几万。”他是麻省理工学院和哈佛大学的三名科学家之一，他们与其他50名研究人员一起谈论了他们撰写的这项研究。
哈佛大学公共卫生学院(Harvard T.H.Chan School of Public Health)流行病学教授卡罗琳·布基(Caroline Buckee)没有参与这项研究，她说，假设研究人员分析的冠状病毒是一个有代表性的样本，她没有问题地相信与会议相关的2万例病例的估计数字。
“超级传播真的是我们如何导致如此严重的流行病的关键组成部分，”Buckee说，他在周二出现在预印服务器上之前收到了一份研究报告的副本。“如果你想一想，全世界所有的案例都起源于一个案例。这就是流行病呈指数增长的本质。“。
研究小组分析了772名患者中导致新冠肺炎的病毒的基因序列，这些患者几乎都来自埃塞克斯、米德尔塞克斯、诺福克和萨福克县。通过检查病毒自我复制时自然发生的遗传密码突变-微妙的变化，就像护照印章一样，显示病原体去过哪里-侦探们确定了今年前五个月感染波士顿地区的80多个截然不同的SARS-CoV-2病毒基因组。科学家们说，大多数病毒来自美国和西欧的其他地方。
但有一种具有独特遗传特征的病毒产生了超大的影响。在772名患者中，约有289人(超过三分之一)感染了一种病毒，这种病毒可以追溯到剑桥生物技术公司(Cambridge Biotech Biogen)2月26日至27日举行的会议上。
研究称，289例与会议相关的病例包括居住在波士顿地区无家可归者收容所的122人和在那里工作的员工，这一显著迹象表明，病毒可能会以不可预测的方式传播，并对社会上最脆弱的成员造成不成比例的损失。目前还不清楚病毒是通过什么途径到达那里的。
通过将四个县中每个县与会议相关的病毒基因组比例乘以埃塞克斯、米德尔塞克斯、诺福克和萨福克的冠状病毒感染总数，科学家估计可能有2万人的感染与万豪事件有关。
这项研究从未提到Biogen的名字。它简单地指的是“2月26日至27日在波士顿举行的国际商务会议”。
“我们不是想指责，”布罗德的病原体监测主任、其中一位接受采访的作者布朗温·麦金尼斯(Bronwyn MacInnis)说。“一些(病毒式的)介绍失败了，另一些则引火烧身。这一事件的情况-它发生得如此之早，以及我们在公众意识中处于COVID的什么位置-意味着它具有不成比例的影响。它发生在一个没有被‘唤醒’的城市。“。
作为回应，Biogen表示，会议上的疫情发生在近六个月前，当时人们对新冠肺炎的了解有限。但该公司并未对这项研究或2万起与会议相关的案件的估计提出异议。
“我们绝不会故意将任何人置于危险之中，”该公司在一份声明中表示。“当我们得知多位同事生病时，我们并不知道死因是新冠肺炎，但我们立即通知了卫生部门，并采取措施限制传播。”
今年4月，该公司加入了包括布罗德、布里格姆和妇女医院(BRoad，Brigham and Women‘s Hospital)和麻省总医院(MassGeneral)在内的一个小组，建立了关于该病毒的生物和医学数据集合。
生物遗传研究公司说：“今天的世界对这种病毒的传播有了更多的了解，我们很自豪能通过这次合作为战胜新冠肺炎的全球努力做出贡献。”
这项研究是几个机构的研究人员合作进行的，包括博德，麻省总医院和马萨诸塞州公共卫生部。在另一项努力中，卫生部使用接触者追踪统计了至少99例源于会议的冠状病毒病例，然后官员们在3月下旬停止了与生物原相关的感染。
除了莱米厄和麦金尼斯，参与这项研究的布罗德的资深计算生物学家斯蒂芬·沙夫纳(Stephen Schaffner)接受了“波士顿环球报”的采访，谈到了这些发现。
研究小组对从大波士顿地区772名患者中分离出的SARS-CoV-2病毒的基因组进行了测序--科学家能获得的尽可能多--主要是在3月4日至5月9日期间。这些患者曾在麻省总医院(MassGeneral)、波士顿无家可归者医疗保健计划(Boston Health Care For The Homighters Program)和其他医疗机构寻求治疗。
研究人员确认的80个或更多不同的冠状病毒基因组中，有一个显然是在1月下旬一名旅行者从中国武汉返回时抵达的，武汉当时是疫情的中心。这名患者被隔离在马萨诸塞州，研究人员没有发现任何证据表明该患者感染了任何人。
但马萨诸塞州的第一大病例集群似乎源于Biogen聚会，吸引了来自美国和海外的约175名公司领导人。
研究人员测序的772个基因组中，约有37%具有相同的基因签名。其中包括从28名已知参加过会议、在酒店工作或与这些人有直接接触的人中分离出的病毒序列。这28人在会议结束后不久寻求治疗时提供了病毒样本，其中许多人在MGH就诊。
科学家们说，万豪酒店的聚会是一场超级传播的完美风暴。这次活动吸引了来自四面八方的与会者。他们挤进酒店电梯和自动扶梯，开会时紧挨着坐在一起，边吃边喝边社交。这次会议是在许多美国人对新冠肺炎采取预防措施之前举行的。
这三位科学家在一封电子邮件中说：“因为它发生在疫情早期，所以在大容量、关闭、社会距离和掩饰到位之前，它就有机会广泛传播。”
携带会议相关病毒基因组的患者包括122名住在大波士顿无家可归者收容所或与这些人一起工作的患者。许多人通过无家可归者的医疗保健计划寻求治疗。这项研究没有确定避难所。
这三位作者表示，他们不知道病毒是如何从会议传播到无家可归者收容所的。他们在电子邮件中表示：“但这表明，我们都是联系在一起的，更多的弱势群体受到新冠肺炎的影响不成比例-一旦它进入无家可归者社区，它广泛传播的时机已经成熟，”他们在电子邮件中表示。
科学家们强调，他们估计在四个县有2万个与会议有关的案例，这是一个“粗略的计算”。从会议传播的感染病毒的总人数可能要高得多，因为研究人员没有研究这四个县以外的病例，也没有关注国内其他地区或国外的病例。会议上的爆发被认为导致了田纳西州、北卡罗来纳州、印第安纳州、新泽西州、华盛顿特区和海外的一连串病例。
科学家们说：“根据目前的数据，准确估计(全球)涉及的总人数是不可能的，也可能是完全不可能的。”“如果数以万计的人看起来很庞大，重要的是要指出，这是在一场大流行的背景下，感染了数千万人。”
这三位科学家提出了一些警告。他们说，有可能的是，从麻省综合医院和其他医疗保健提供者寻求治疗的患者的病毒基因组不能代表研究人员用来进行推断的县的冠状病毒。
也有可能的是，他们认为在会议上反弹的病毒版本事先从另一个当地的超级传播者事件中未被发现地传播了，然后在万豪酒店感染了人们，这让研究人员对真正的来源感到困惑。但是，科学家们在他们的电子邮件中说，“我们没有看到这方面的证据。”
哈佛生物学教授丹·哈特尔(Dan Hartl)专门研究群体遗传学，他没有参与这项研究，他说他认为2万例的估计是可信的，“尽管我承认这是令人瞠目结舌的。”他补充说，这种与会议相关的病毒可能没有什么不寻常的地方，导致它传播得如此广泛。
“你会说，‘哦，天哪，这一种病毒似乎比其他病毒传播得更快--它有什么特别之处吗？’”他说。“不一定。它只是运气好，在其中一个超级传播者事件中传播开来。“
