新的冠状病毒变异可能导致更多的再次感染，需要更新疫苗

普利策中心和海辛·西蒙斯基金会均支持Science的COVID-19报告。

2020年12月，当巴西马瑙斯的COVID-19病例数再次开始上升时，Nuno Faria感到震惊。伦敦帝国理工学院的病毒学家和牛津大学的副教授刚刚合着了《科学》杂志的一篇论文，估计该市四分之三的居民已经感染了SARS-CoV-2（大流行性冠状病毒），绰绰有余。 ，似乎是为了提高牛群的免疫力。该病毒应与Manaus一起感染。然而，医院再次充满了。 “很难调和这两件事，”法里亚说。他开始寻找可以测序的样本，以查明病毒的变化是否可以解释死灰复燃。

1月12日，Faria和他的同事在virologic.org网站上发布了他们的初步结论。 12月中旬在马瑙斯（Manaus）采集的31个样本中有13个被证明是他们称为P.1的新病毒谱系的一部分。需要做更多的研究，但他们说一种可能性是，在某些人中，P.1不会引起2020年初席卷这座城市的血统所引发的人类免疫反应。

自从科学家对B.1.1.7发出警报以来，就已经出现了冠状病毒的新变种.B.1.1.7是一种SARS-CoV-2变种，自12月在英国首次引起科学家的关注以来，比以前传播的病毒更容易传播。但是现在，他们也将重点放在潜在的新威胁上：可以最终绕过人类免疫反应的变体。这样的“免疫逃逸”可能意味着更多已感染COVID-19的人仍然容易受到再感染，而且经过验证的疫苗在某些时候可能需要更新。

在1月12日的世界卫生组织（WHO）会议上，数百名研究人员讨论了由新突变浪潮引发的最重要的科学问题。世卫组织还于1月14日召集了其COVID-19紧急委员会，讨论了新变种的影响以及许多国家强行限制它们的旅行限制。该委员会呼吁全球努力测序和共享更多SARS-CoV-2基因组，以帮助追踪突变。它还要求各国支持“全球研究工作，以更好地了解有关SARS-CoV-2特定突变和变异的关键未知数。”

更具传播性的变体B.1.1.7已在英国，爱尔兰和丹麦以及其他许多国家迅速传播。美国疾病控制和预防中心周五发布了一项建模研究，显示该菌株可能在3月成为美国的主要变种。但是科学家们同样担心501Y.V2，这是在南非发现的一种变体。它携带的某些突变，包括名为E484K和K417N的突变，会改变其表面蛋白，尖峰，并且在实验室中已显示出这种突变可降低单克隆抗体抵抗病毒的能力。在本月早些时候发布的预印本中，弗雷德·哈钦森癌症研究中心的进化生物学家杰西·布鲁姆（Jesse Bloom）表明，E484K还将一些供体的恢复性血清的效价降低了10倍-尽管他很快补充道，但这并不一定意味着这种突变会导致人们对新菌株的免疫力下降10倍。

P.1之所以令人担忧，是因为它似乎击中了类似的突变群，并且出现在免疫力很高的地方。 “任何时候，您都会看到相同的突变出现并开始在世界各地的不同病毒株中传播多次，这确实有力地证明了这些突变具有一定的进化优势，” Bloom说。

像B.1.1.7一样，在Manaus中识别的变体已经在移动中。就在法里亚（Faria）完成对巴西基因组的分析之时，也发表了一份报告，报道了从巴西到达日本的旅行者中发现的一种变异-事实证明是P.1。

这些新的变种如何影响大流行的过程仍不清楚。例如，在马瑙斯（Manaus），P.1可能与新的感染激增无关。牛津流行病学家奥利弗·皮伯斯（Oliver Pybus）说，人们的免疫力可能只是在减弱。世卫组织的迈克·瑞安（Mike Ryan）在今天的新闻发布会上警告说，人类行为的改变仍然是复苏的主要动力。他说：“将责任归咎于变体并说是造成这种情况的病毒太容易了，” “不幸的是，这也是我们没有做到的。”

即使该变体起关键作用，它也可能驱动增强，因为它像B.1.1.7一样更容易传播，而不是因为它可以逃避免疫反应。 “当然，也可能是这些因素的结合，” Pybus说。类似地，在最近的建模研究中，伦敦卫生与安全学院的研究人员对热带医学计算得出，南非的501Y.V2变异体可以传播50％以上，但在逃避免疫方面却没有更好的表现，或者与以前的变异体一样可以传播，但能够在以前感染的五分之一的人群中逃避免疫。作者写道：“现实可能介于这些极端之间。”

圣保罗大学的分子生物学家Ester Sabino正在开展一项研究，以发现马瑙斯的再感染，这可能有助于在P.1的这些假设之间做出决定。她还正在努力从1月开始对来自马瑙斯（Manaus）的更多样品进行测序，以追踪变种的传播。她说：“我们还没有数据，但我想现在是100％。”研究变异的实验室研究也在进行中。英国今天发起了一个新的财团，由伦敦帝国理工学院的温迪·巴克莱（Wendy Barclay）领导的G2P-UK（“基因型到表型-英国”）研究SARS-CoV-2中新出现的突变的影响。在1月12日世卫组织会议上讨论的一个想法是建立一个生物库，以通过存放病毒样本以及疫苗接种者和康复患者的血浆来帮助进行研究。

新突变之间的相互作用可能使得更难弄清它们的作用。来自英国，南非和马瑙斯（Manaus）的变体都共享一个名为N501Y的突变，例如某些研究人员称之为Nelly的突变。但是，这种影响刺突蛋白的突变也发生在某些不能快速传播的变体中，这表明N501Y并不是单独起作用的，Scripps Research的克里斯蒂安·安德森说：“妮莉可能是无辜的，除非她和坏朋友在一起时。”

布卢姆认为，这些变化都不会使病毒完全逃避免疫反应。 “但我希望当许多人都具有免疫力时，这些病毒会有所优势”，这可能有助于解释马瑙斯的激增。

世卫组织COVID-19疫苗工作组主席，疫苗学家菲利普•克劳斯说，到目前为止，该病毒似乎似乎尚未对COVID-19疫苗产生抗药性。他补充说：“不太好的消息是，这些变体的快速进化表明，如果病毒有可能进化成疫苗抗性表型，那么这种情况可能会比我们希望的发生得更快。”佛罗里达大学的生物统计学家纳塔莉·迪安说，这种可能性增加了对早期发现此类逃生变种进行良好监视的紧迫性。柏林Charité大学医院的病毒学家Christian Drosten说，但这也增加了给人们接种疫苗的紧迫性。他说：“我们必须尽一切努力为尽可能多的人接种疫苗，即使这意味着冒着选择某些变种的风险。”

如果出现抗疫苗的SARS-CoV-2株，则可能需要更新疫苗。克劳斯说，可以很容易地改变几种疫苗以反映最新变化，但是监管机构可能不愿批准它们，却看不到更新的安全性和功效数据。如果新的变体与旧菌株一起传播，则可能甚至需要针对多种谱系有效的多价疫苗。 “要明确：这些是下游考虑因素，” Krause说。 “公众不应认为这迫在眉睫，而需要新的疫苗。”但是剑桥大学的研究人员拉文德拉·古普塔（Ravindra Gupta）表示，制造商应该开始生产旨在对刺突蛋白突变型产生免疫力的疫苗，因为它们会不断出现。 “它告诉我们，我们的疫苗中应该包含这些突变，这样您就可以关闭病毒传播的途径之一。”

乔治敦大学的病毒学家安吉拉·拉斯穆森（Angela Rasmussen）说，目前，最大的担忧是透射率的提高。她说：“我很困惑为什么[那个]不在对话中占更大的比重。”她说，美国的医院系统“在许多地方都已达到极限，传输的进一步增加可能使我们陷入系统崩溃的边缘。然后，我们将开始看到死亡率的潜在巨大增长。”