在2020年1月初的一个星期六早上在澳大利亚是在澳大利亚,与中国科学家谈过的是叫永珍张的电话,他刚刚测量了一种在武汉感染人民的新病原体的基因组。这两个人 - 老朋友 - 辩论结果。 “我知道我们正在看呼吸道病毒,”悉尼大学的病毒学家和教授回忆起福尔摩斯。他也知道它看起来很危险。
他能公开分享遗传代码吗?福尔摩斯问道。张在中国,在一架飞机上等待起飞。他想思考一分钟。所以福尔摩斯等了。他听到了一个乘务员敦促张某关闭手机。
“好的,”张先生终于说道。几乎立即,福尔摩斯在一个名为Virology.org的网站上发布了序列;然后他把它与Twitter联系在一起。福尔摩斯知道世界各地的研究人员将立即开始解除Puredogen的代码,以便找到击败它的方法。
从病毒基因组首次由福尔摩斯发布的那一刻,如果你看,你可以在我们的公共卫生对SARS-COV-2的各个方面找到一个遗传组成部分。例如,它通常是药物公司需要病毒样品以产生疫苗。但是,一旦序列在公共领域,现代人在剑桥,群众的晦涩难以置疑的生物技术公司,立即开始与计划的国家健康研究院合作。 “他们根本从未有过病毒;他们真的刚刚使用了这个序列,他们将其视为一个软件问题,“Illumina的首席执行官Francis desouza使得张某使用的序列仪来说,在去年夏天,六个月在现代疫苗接受了六个月之前告诉我食品和药物管理局应急使用授权。病毒的代码也将测试行业设置为运动。只有通过分析病毒的遗传序列的特征方面,科学家们可以为称为P.C.R的设备创造套件。多十年的机器使用遗传信息来制定快速诊断测试。
与此同时,排序用于跟踪病毒突变 - 从2月2020年2月发布的研究开始,表明病毒在美国蔓延这种作品在基因组流行病学或“Gen Epi”的领域内,或“epi”属于那些在该领域倾向于称之为。许多见解日期到20世纪90年代中期和英格兰牛津的一群研究人员,其中他们中间的福尔摩斯。他们认为,在每10天(如流感)或每20天(如埃博拉)中获得持久突变的病毒中的进化变化是本质上的 - 而且,随着我们现在所知,在动物中,本质上更有用 - 进化可能发生在一百万年内。
早期的障碍是工作的繁琐性质。牛津小组必须通过缓慢和刻意的过程来分析遗传标记,可以提供对每个新变种的几十个特征的洞察。直到2000年代后期,遗传排序机的急剧改善,辅助计算能力的巨大飞跃,允许研究人员更容易,快速阅读病毒的完整遗传码,以及人类,动物的遗传蓝图,植物和微生物。
在公共卫生领域,2014年在广泛的M.I.T研究所的一支球队时,通过更快的基因组测序启用的第一个大型突破之一。在非洲的爆发期间,哈佛开始从受害者的埃博拉病毒的样品进行排序。该工作表明,通过对比遗传码,可以识别和中断传输的隐藏途径,具有减缓(甚至停止)感染的差异的可能性。这是第一个叫做遗传监视的真实用途之一。几年后,医生携带便携式基因组排序器开始跟踪中美洲和南美洲周围的寨卡病毒。序列仪越来越好,更易于使用。
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