在巴西发现的SARS-COV-2变体：更传染性，可能会限制免疫力

几乎从它使跳跃到人类的那一刻起，SARS-COV-2病毒一直在挑选突变并在扩展到不同人群时创造新的谱系。实际上，绝大多数这些突变绝对没有区别;得到的病毒具有与未传统形式的特性相同，＆＃39;

但是有许多案例频率涌现的变体。在大流行早期，这通常是变体的产品进入以前未曝光的人群 - 一个机会而不是病毒的特征。从突变使病毒更危险的情况下分离出这些情况是一个严重的挑战。但本周，一支国际研究人员队发表了证据表明，在巴西首次以其特征在一起的变种可能代表着重要的额外威胁。

有很多关于细节的不确定性，但病毒似乎更传染性，更有可能感染那些对其他病毒株具有免疫力的人，并且它甚至可能更致命。而且，截至何时编写了纸张，血统已在35多个国家发现。

今年早些时候，我们描述了巴西·马瑙斯的局势，这是冠状病毒感染的第一波困难。但是，尽管对巴西政府对大流行的响应无动于衷，但导致一些城市可能已达到足以提供畜牧业的感染程度，尽管对大流行的响应无关紧要。

这一有希望的思想在12月结束了，当时一阵感染在城市开始，紧张其医疗保健系统并导致另一个浪涌死亡。感染率非常高，这提出了怀疑，即可能存在一种新的病毒菌株，其可以避免在第一波期间发生的感染产生的免疫应答。

巴西医疗保健工人通过测序导致第二波感染的病毒的基因组来对案例的增加作出反应。在该第二波之前，只有七种病毒基因组从亚马逊获得，Manaus所在的状态。新的努力增加了这一数字184年，虽然并非所有这些都是完整的基因组。

基因组揭示了谱系研究人员的存在呼叫p.1，这是在第一波期间存在的应变的脱震。从那时起，P.1拾起了大量突变，其中包括17个单独的突变，其改变了它编码的蛋白质的氨基酸序列，一种插入新碱基，以及三种缺失的碱基。这是一个大量的变化，并提出了自3月以来的高水平突变。时间估计表明，P.1起源于11月，就在马瑙斯的大型第二波开始之前。

在第二波的过程中，P.1变体在占七周后的87％的病毒中的样品中不可检测到。巴西其他地方的病毒基因组表明它也在该国内迅速蔓延，展现在源自Manaus的流行飞行路线的城市。这表明P.1可能起源于城市。

使用聚合酶链反应（PCR）的病毒的试验涉及病毒的循环扩增＆＃39; s基因组。结果，如果您从更多的病毒基因组开始，请＆＃39; LL在更少的循环中达到可检测的信号水平。这被认为是指检测病毒所需的循环计数提供了样本来自的人携带的病毒载荷的粗略量度。在P.1菌株的情况下，试验显示出相当一致的，如果小，指示病毒载荷。

因为在感染后，样品在不同的时期出现，但研究人员可以＆＃39; T告诉这是否指示病毒的最大水平更高或更长的感染持续时间。也没有特别好。

为了了解P.1可能影响Manaus中的第二波感染，研究人员开发了一种流行病学模型，使他们能够跟踪两种不同的病毒菌株。第一种菌株被设置为SARS-COV-2的典型特性。对于第二种，它们能够调整病毒的性质，例如通过先前感染提供的免疫力及其传播性。这让它们确定哪些属性与Manaus中第二波的动态一致。

总体而言，该模型表明P.1可能比SARS-COV-2的现有菌株更可传递，并且它可能大约是传染性的两倍。在某种程度上，它也可以抑制过去感染产生的免疫应答。该模型建议在那里＆＃39;这至少有10％的可能性可以逃避免疫力，但它＆＃39;不太可能超过50％的机会。

由于P.1菌株感染引起的致死性有些证据。但是，菌株的时序＆＃39; S崛起是这样的证据来自医院的濒临淹没的时期。所以作者谨慎地对待这种可能性。

什么可能导致这些变化？在P1菌株中的至少10个突变影响病毒＆＃39; S穗蛋白，病毒用于锁定它感染的细胞。这些突变中的至少八个似乎已经选择了在菌株的过程中＆＃39;演变的过程中，这表明他们有助于使其更传染。在引起了问题的另一种血谱中也已经看到了三种具体变化，并且已经显示出至少一个干扰攻击病毒的抗体。

因此，虽然这种数据是＆＃39; t真的是一个决定性的指示，P.1对我们构成了明显的威胁，它＆＃39;何种肯定与这一问题一致。 它将有助于解释为什么Manaus有两个不同的波浪似乎遇到了大部分城市和＃39;人口。 尽管如此，作为新论文的作者指出，我们完全了解改变抗体靶向蛋白质的突变的后果。 直到我们抓住这一点，我们赢得了＆＃39;真的知道我们需要有多担心p.1和其他变体。