古老便利揭示人体肠道细菌的“灭绝事件”

在丰富的细菌的帮助下，你吃的每顿饭都会消化吞噬你的肠子。当你完成消化时，那些细菌也是排泄的一部分。现在，1000年历史的干涸大便正在提供卫生，加工食品和抗生素的数十亿强细菌生态系统如何改变人体肠道的洞察力。

在今天发表的一项研究中，研究人员分析了佛罗里帽或保存的粪便，在犹他州和墨西哥的岩石避难所的后面发现了古代DNA。斯坦福大学生物学家Justin Sonnenburg说，数据给科学家们首次好看古老的肠道细菌社区。 “这些古墓是相当于时间机器的。”

他们建议，在过去的千年里，人肠势肠势率经历了“灭绝事件”，失去了数十种物种并变得越来越多的多样化，说领先作者和哈佛医学院微生物学家Aleksandar Kostic。 “这些是我们不＆＃39; t回来的东西。”

以前的研究使用了今天的肠道细菌猎人和牧民作为古代微生物组的代理。他们的微生物多样性远远超过工业社会人民，研究人员将低多样性与糖尿病，肥胖症和过敏症的“文明疾病”的较高率联系起来。但它不是明确＆＃39;非工业人民与古代人类共同的人。 “我们真的希望能够及时回去看看[现代肠道微生物组织的改变吗？哈佛大学遗传学家克里斯蒂娜·克里诺纳（Christina Weninner）是一位合作的纸。 “它是食物吗？是它处理，是IT抗生素，是卫生设施吗？“

国际团队分析了墨西哥三个岩石避难所的干燥和稳定温度保存的八个古猿九群，并在美国西南部。研究人员Radiocarbon日出了样本，其中一些几乎100年前挖掘，储存在博物馆，到0 CE和1000 Ce Meradeth Snow，Montana大学的分子人类学家Missoula，然后再次再次粪便粪便，恢复比以前的古价分析更长的DNA链。

Ph.D表示，初步尝试分析古老的肠道微生物分析古老的肠道微生物群体被分析了古老的肠道细菌DNA的挑战。哈佛＆＃39;乔斯林糖尿病中心的学生分析了DNA。她专注于被时间损坏的DNA和已知与哺乳动物肠道有关的细菌的序列，她挑出了古老的肠道。然而，一些古老的DNA是不熟悉的，显然代表了从未出现的灭绝细菌。

巨石菌素产生了181个基因组，古老，可能来自人体肠道。许多人像今天在非工业肠样品中发现的那些，包括与高纤维饮食相关的物种。样品中的食物位证实，古代人＆＃39;饮食包括玉米和豆类，典型的北美农民。犹他州的网站的样品提出了更加薄饼，富含纤维的“饥荒”，包括刺梨，稻草和蚱蜢。

但古老的微生物体也与他们的现代同行分开，例如缺乏抗生素抗性的标记。他们显着更多多样化，包括数十种未知的物种。 “在比较狭窄的地理位置和时间段的八个样本中，我们发现了38％的新种类，”Kostic说。

例如，蛋白质细菌在工业化肠道微生物组中几乎是未知的，并且仅偶尔出现在今天的人们生活的非工业生活方式中。但是，“他们＆＃39;在所有地理位置的每个地理位置中，在每一个地理位置中，”他们在所有地理位置中出现。“ “这表明它并不纯粹的饮食＆＃39;塑造东西。”他希望未来从其他时间段的副植物的实验将使在最大的转变发生并且促使它们时可以抵消。

该研究结果回应了本周发表的Warinner及其同事的许多旧样品的另一个研究，其中报道了来自尼安德特人和早期现代人类的先前未识别的微生物的DNA。

来自旧大便的新数据今天今天的星球上没有人们对微生物组的变化进行了备受变化。 “非工业人口，包括他们的微生物体，应该被认为是我们祖先的代理人，”马萨诸塞术遗传学家Mathieu Groussin说。

调查结果也建议我们在最近的过去失去了很多微生物助手，我们的机构可能没有时间适应。 “这项研究为我们提供了一项金标准，以检查我们失去的物种丢失了什么，”Sonnenburg说。

由于粪便逃离，曾经被认为是人类仍然是美国法律，Warinner表示，关于研究伦理的早期讨论很少。但是当该集团在西南部达到几十个部落时，有些人说样本是与他们的祖先的联系，并令他们沮丧的是，他们早先咨询过＆＃39;该研究现在包括道德语句，是古墓纸的第一个。

加州大学圣地亚哥，遗传学家Keolu Fox说，团队没有走得太远。他说，有一天有一天会导致古老的肠道可能会使商业努力推出现代微生物群体。这提出了谁拥有此类数据的复杂问题。 “它＆＃39;据说浪费，但它含有微生物多样性的DNA和概况。福克斯说，也许大便就是黄金，“福克斯说。 “我们＆＃39;再进入一个全新的灰色区域。”