背景技术B.1.617.2 Covid-19变体有助于印度案件的激增，现已在全球检测到，包括英国案件的显着增加。我们估计BNT162B2和Chadox1 Covid-19对该变体的疫苗的有效性。
方法采用试验负案控制设计来估算B.1.617.2在基于测序和S-基因靶位状态鉴定的病例循环的时期与症状对症状对症状疾病的有效性。关于英格兰Covid-19的所有症状测序案例的数据用于估算B.1.617.2的病例比例与疫苗接种状态相比（B.1.1.7）相比。
结果效果在1剂疫苗后效果显着降低33.617.2例33.5％（95％CI：20.6至44.3），而B.1.1.7例51.1％（95％CI：47.3至54.7），结果对于疫苗。 BNT162B2 2剂量有效性从93.4％（95％CI：90.4至95.5）减少，B.1.1.7至87.9％（95％CI：78.2至93.2），B.1.617.2。 Chadox1 2剂量有效性从66.1％（95％CI：54.0至75.0）降低，B.1.1.7至59.8％（95％CI：28.9至77.3），B.1.617.2。与未接种寄存的病例相比，1或2剂疫苗接种后检测到的测序病例具有较高的感染可能性较高的感染可能性较高（或1.40; 95％CI：1.13-1.75）。
结论2剂任一疫苗后，疫苗效果只有适度的差异，V.1.617.2变体。疫苗效果的绝对差异较多，剂量1.这将支持最大化疫苗摄取，弱势群体中的两种剂量。
印度在Covid-19案件中经历了2021年后的19例案件，并且每天于5月2021年初达到40万个案件和4000人死亡。（1）这导致医院服务在氧气供应（2）中越来越稀缺已经测序了一小部分样品，B.1.617谱系占主导地位。 B.1.617.2于2020年12月在印度检测到，从4月2021年中期，该国成为该国最常见的变种。（1）截至2021年5月19日，该变体已在6个各大洲的43个国家检测到在GISAID。（3）在英国，这种变体与前往印度和社区传播相关的情况迅速增加。 （4）
英国已达到Covid-19疫苗的快速推出，从2020年12月开始，牛津生物BIONTECH BNT162B2 mRNA疫苗的部署开始，随后由牛津 - Astrazeneca Chadox1腺病毒矢量疫苗从1月2021年开始，最近的现代MRNA - 1273疫苗。疫苗最初是为老年人，护理人员和健康和社会护理工作者优先考虑，随后推出临床风险群体和较年轻的年龄队列的临床风险群体。（5）在卷展览的早期阶段，并遵循联合委员会的建议疫苗和免疫，策略决定使用长达12周的延长给药间隔，以最大化在大流行的第二波中接受第一剂量的脆弱性的数量。（6）
来自临床试验的证据已经发现疫苗在预防症状性疾病方面非常有效。（7-9）这已被真实世界的证据支持，显示出对症状性，感染和严重疾病的高度效果。（10-14）临床试验的早期发现主要是在原始武汉SARS-COV-2菌株是主要循环病毒和针对不同变体的有效性的数据的环境中进行的。 B.1.1.7变体首次在英国确定，是1月至5月2021年期间所见的主要谱系。现在有实质性证据表明，疫苗接种赋予的保护水平与临床试验中观察到的水平相似针对严重疾病的额外保护。（10,11,15-17）实验室数据表明B.1.351变体从接种疫苗的个体中通过血清中和。（18,19）来自卡塔尔的观察数据表明对症状疾病的有效性较低通过这种变体，但在与BNT162B2接种的那些中，对严重，临界或致命疾病的高水平有效性。（17）此外，NovaVavax NVX-COV2373疫苗的试验发现51.0％对B.1.351的疗效。（20）最后，高水平用BNT162B2引发血清的P1变体已经看到中和，尽管尚未报道疫苗效果的现场测量。（19,21）
B.1.617.2变体的特征在于尖峰蛋白突变T19R，δ157-158，L452R，T478K，D614G，P681R和D950N。（1）这些突变的几种可能会影响针对受体关键抗原区域的免疫应答结合蛋白（452和478）和缺失部分N末端结构域。（22）P681R在S1 / S2切割部位，研究表明，该位点的突变菌株可能增加复制，导致更高的病毒载荷和增加的传播。（23）尚未向B.1.617.2变体报告免疫原性数据。此外，没有报告关于Covid-19疫苗对具有这种变体的临床结果的有效性的数据。
在这项研究中，我们的目标是估计Covid-19疫苗与B.1.617.2变体对症状疾病的有效性。
首先，测试负案例控制（TNCC）设计用于估计与B.1.1.7变体相比同期的B.1.617.2变体对症状疾病的疫苗有效性。别的地方详细描述了这种方法。（10）将短暂的疫苗接种状态与报告症状报告症状但测试负面的症状。这有助于控制与健康寻求行为有关的偏差，访问测试和案例确定。
其次，通过疫苗接种状态估算了相对于主要循环病毒（B.1.1.7变体）的B.1.617.2变体的案例比例。潜在的假设是，如果疫苗与每种变体同样有效，与接种疫苗的个体相比，预期在未接种的情况下预期任何变体的情况。相反，如果疫苗对B.1.617.2效果较低，则预期该变体将在疫苗接种后超过三周的案例，与未被接种的个体相比。
与Covid-19疫苗接种的英格兰所有个人的数据都可以在国家疫苗接种寄存器（国家免疫管理系统，NIMS）中提供。在2021年5月2021年5月2021中提取包括每种剂量的疫苗和疫苗型的数据。接种疫苗接种状态被认为是症状发作的剂量1 21天或更长时间左右的症状发作收到2个ND剂量;剂量2用于症状发作=在第二剂后14天或更长时间;剂量1（包括剂量2后的任何时期）和剂量1或2至21天或更长时间。
英国的Covid-19 PCR测试通过医院和公共卫生实验室以及通过驱动器或家庭测试进行社区测试，这些测试可供任何与Covid-19（高温，新的连续咳嗽，丢失或嗅觉或味道的变化）。提取了2020年10月26日和5月16日之间的所有阳性PCR试验。还提取了个体报告症状的所有阴性群落测试，用于测试负案例控制分析。截至3月21日2月21日截至3月21日的16岁以下的儿童被排除在外。数据仅限于个体报告症状，只包括在症状发作后10天内测试的个体，以减少PCR测试的敏感性超越这一时期。（24）
全基因组测序用于鉴定B.1.617.2和B.1.1.7变体。在2021年2月2021年2月2021年的约10％测序的所有阳性样本的比例均稳步增加，5月2021年5月约为60％。（4）在实验室网络中进行排序，包括高比例Wellcome Sanger研究所和序列被分配给公共卫生英国的单一核苷酸多态性基于基于的变体定义。（25）
作为识别每个变体的第二种方法，使用三个目标PCR测定（TaqPath; Thermo Fisher）来区分试样在尖峰基因靶标上测试样品。 B.1.1.7变体占英格兰98％至100％的尖峰基因目标故障。在测试的S基因阳性72.2％的测序样品中，4月2021中的B.1.617.2和5月份的93.0％是B.1.617.2（截至5月2021日）。（4）
描述的三个数据源使用国家卫生服务号码，出生日期，姓氏，名字，邮政编码和标本标识符和样品日期相关联。
还从NIM和测试数据提取了一系列可能与提供或接受疫苗的可能性以及接受疫苗的可能性以及接触患有Covid-19或特异性的任何变体的风险。这个包括年龄（十年年龄组），性别，多种剥夺指数（昆泰），种族，护理家庭地位，外国旅行历史，区域，期间（日历周），健康和社会护理工作者的地位，临床上极脆弱对于TNCC分析，疫苗接种程序开始前感染的历史。如果在请求考试的14天内的英国和爱尔兰在英国和爱尔兰境外旅行，或者在家中检在家里或在家中被检察时，他们被认为已经录得的人。邮政编码用于确定多种剥夺的指数，并使用独特的属性参考号来识别护理室。（26）
对于TNCC分析，与测试阴性对照相比，使用逻辑回归来估计症状PCR确诊病例之间的疫苗接种的几率。通过测序或在TaqPath PCR测定上鉴定为B.1.617.2的病例。在测序中鉴定为B.1.1.7的病例，或者在TaqPath PCR测定上是S-基因靶标阴性。
如果个人在90天的时间内（可能代表单一疾病发作）在多次在多次测试阳性时，则只有第一个阳性测试。每人最多包括3个随机选择的负测试结果。在阳性结果之前三周内或在阳性结果之后，排除了在以前的负样品的七天内拍摄的阳性结果，或者在以前的阴性样品的七天内进行。此前在分析期之前测试过阳性的个体也被排除在外，以估算完全易感个体的疫苗效果。所有协变量都包含在模型中，如先前的TNCC分析，其中一周包括一个因素，没有与地区的互动。
对于S-基因靶标分析，仅包括在其他两个PCR基因靶标上进行阳性的个体。这些限制为第12届4月12日开始的一周，以旨在为B.1.617.2变体的S-Gene靶标的高特异性。（4）
估计剂量一个剂量的疫苗效果估计在第一次剂量后21天或更长时间和剂量两剂量后的剂量，在第二剂后14天或更长时间。对未接种催化的个体进行比较，并与第4-13天进行比较，以帮助解释感染风险的差异。 0-3天期间被排除为因子对疫苗的反应性可能导致测试的偏差导致如前所述的结果增加。（10）
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案件数量和随访期目前不足以估计对严重疾病的有效性，包括住院和死亡率，然而，以前的疫苗效应估计与其他变体的估算显示出更高水平的效果，对更严重的成果较高。（10,14,28）因此，B.1.617.2疫苗，可能预期对严重疾病的更高水平。
这是我们意识到关于对B.1.617.2变体的疫苗效力报告的第一研究。我们也无法找到此变体的任何中和数据。来自印度的一项研究报告了具有更广泛的B.1.617变异类别的中和数据，表明Covid-19病例和来自BBV152（Covaxin）疫苗受体的枢纽血清均能够中和B.1.617。（29）假设这一点其中大量比例为B.1.617.2，其有效性对不同疫苗的影响是相似的，这将支持我们的研究结果。与近期调查结果与卡塔尔比较BNT162B2对B.1.1.7和B1.351变体的有效性相比，我们的研究结果表明，在整个课程在这两者之间的某个地方之后，对B.1.617.2的有效性。（17）
英国的大规模的测试和全基因组测序以及在国家疫苗接种登记册中记录疫苗接种状态，使我们能够在英国最初出现的变体的几周内分析疫苗效果。我们使用两种不同的分析方法，其具有广泛类似的结果和调查结果，我们的控制分析（使用B.1.1.7）与先前报道的那些相一致。（7,8,10,17）发现与第一个相比也类似第一次疫苗（补充）发布2周，这有助于排除与接种疫苗的可能性以及暴露于变体的可能性相关的未测量混淆。使用TNCC设计还帮助我们控制不同
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