西雅图科学家挖出删除的冠状病毒遗传数据

2021-06-24 05:07:34

一位美国科学家在冠状病毒的起源中煽动了新的小冲突,报告说他已检索有关SARS-COV-2的潜在重要的遗传数据,这些数据已经存储,后来从国家健康机构删除了数字档案。

杰西·布朗(Jesse Bloom)在西雅图的Fred Hutchinson Cancer Research Center的计算生物学家们在预印刷服务器Biorxiv上发布了他的研究结果,其中尚未在期刊上尚未对同行评审或公布的论文一直在降落大流行。

盛开的研究的科学意义仍然不明确于周三,但它激起了瞬间在线反应,有利和不利的相似,在科学家中,他们一直辩论关于初始冠状病毒爆发的原理的势力。

绽放,他通过谷歌云检索数据,并不声称它推进了一个理论或另一个理论,但他争取了它的证据表明,在十二月爆发的Covid-19之前,病毒在中国武汉流通了病毒的证据这种病毒与销售活动物的市场相关联。

什么不是争议是数据被从NIH的数据库中删除。该数据包含在2020年3月发表的预印文纸中,并在杂志中发布了6月。

NIH释放了一份声明,周三表示,最初发布的研究员要求他们从NIH数据库中删除它们,以便它们可以包含在不同的数据库中。 NIH表示,如果要求这样做,它是删除数据的标准做法。 NIH声明没有确定要求从代理商的序列读取存档中切除材料的科学家,称为SRA。

“这些SARS-COV-2序列在2020年3月在SAR中发布,随后提交调查人员于2020年6月被提交。请求者表示已更新的序列信息,正在提交给另一个数据库,并通缉从SRA中删除的数据以避免版本控制问题,“NIH说。

声明说,NIH“无法推测超出提交者的意图之外的动机。”

Bloom在一封电子邮件中说给华盛顿邮报,他没有指责NIH的错误行为。但是Bloom的在线论文建议删除数据违反科学规范和对科学至关重要的信任准则。在Twitter上,Bloom表示数据也从中文数据库中取出。

“他目前的研究表明,至少在一个情况下,科学的信任结构已被滥用,以模糊与武汉SARS-COV-2的早期传播相关的序列。”布兰德写道。

职位努力到达测序纸的高级作者已经取消了不成功。

罗杰特F.Garry是一个坦伦大学病毒学家,他们共同编写了一个有影响力的3月2020篇论文,称SARS-COV-2是一种自然病毒,并没有设计,发表了新的盛开纸。

“Jesse Bloom发现完全没有什么新的科学文学,”Garry写在一封电子邮件中。他叫盛开的纸“炎症”。

绽放对病毒起源的辩论没有陌生人。他是致报刊的杂志的主要作者,由一个额外的17名着名科学家签署,上个月批评了世界卫生组织探讨了病毒的起源。这封信呼吁深入调查“实验室泄漏”假设,这尖叫着冠状病毒 - 意外或设计 - 潜在地溜出了武汉的实验室。

斯坦福大学微生物学家David H. Relman是那封信的另一个组织者,绽放的调查结果:“它显示了如何在尝试推断病毒进化路径和起源时寻求,保存的早期数据和分支的重要数据,因为早期数据总是稀疏开始,因为分析对恰好可以使用的特定数据非常敏感。“

在他的论文中,Bloom并没有声称他检索的数据推进了实验室泄漏或天然动物病的论据。

“这项研究无论是无论如何都没有提供证据,”Bloom在一封电子邮件中说。 “但它确实表明我们可能没有耗尽所有相关数据。”

他补充说,“我认为科学家我们真的需要专注于以下两个问题:我们如何获得更多数据?我们如何更好地分析我们拥有的数据?“

Bloom表示,他恢复的删除序列加强了以前分析支持的概念,包括从今年早些时候对病毒的起源进行的世卫组织的调查的结论:该病毒可能会在2019年12月期间在华南海鲜市场爆发之前感染人员。这种传播事件虽然大,但不一定是人类中SARS-COV-2的第一个例子。

W. Ian Lipkin,哥伦比亚大学流行病学家通过电子邮件表示,盛开的纸张提供“我们许多人推测的证据 - 这种病毒在市场爆发之前流通。序列数据的缩回是前所未有的,必须解决。“

加州大学在圣地亚哥进化生物学家Joel Wertheim研究了湖北省病毒的出现,说:“我实际上并不认为这项研究增加了争论的争论。”

与感染许多人在海产品市场的病毒相比,分析序列分析与蝙蝠的冠状病毒亲属更大的相似性。但研究人员已经意识到冠状病毒的两种遗传谱系,在1月和2月20日,Wertheim表示,“这些基因组片段进一步证明这一点”。

在星期三在Twitter上出现猜测,盛开的发现可能会改变病毒的时间表,但Wertheim表示怀疑:“我不相信这篇论文对改变我们的分子时钟估计的强大案例,因为类似 - 更完整 - 数据纳入以前的研究。“

拜登总统命令智力机构进行审查,这些信息可以阐明病毒的起源。在周二出版的雅虎新闻采访时,国家情报艾弗里尔海恩斯主任表示,从未发现过终极答案。

“我们希望能找到吸烟枪,”Haines说,但是“这样做是挑战”。她补充说:“可能会发生,但它可能不是。”

Haines表示,除了采取新闻已经收集的信息外,队伍正在寻求收集新的智力。

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