在1966年被遗忘的组织样本中发现最古老的“几乎完整”的艾滋病毒基因组

一项新的研究发现，在刚果民主共和国(DRC)的一个组织样本中发现了已知的最古老的几乎完整的HIV毒株基因序列，该毒株传播到世界各地。

组织样本是在1966年采集并保存的，这使得这个HIV序列比之前最古老的基因组早了10年，后者来自1976年在刚果民主共和国采集的血液样本。像这样的基因序列-来自1983年发现导致艾滋病的病毒之前-有助于精确定位病毒基因突变的时间。反过来，这些突变又帮助科学家追踪病毒的传播和HIV在人类中传播的时间。

这项新研究的合著者、比利时鲁汶天主教大学进化和计算病毒学博士后研究员索菲·格里塞尔说，从这个意义上说，新的基因序列非常令人欣慰。她告诉“生活科学”，这一序列很好地符合研究人员之前对艾滋病毒出现时间的理解。

Gryseels说，很高兴知道这一点，因为这意味着我们一直应用于病毒序列的进化模型运行良好。我们没有太大的惊喜。

根据对病毒样本的基因测序，科学家们认为，HIV，或称人类免疫缺陷病毒，在20世纪初的某个时候首次在中非的人类身上找到了立足点，并从黑猩猩身上蔓延开来。这种病毒有多种毒株，但导致全球95%的病例的是一个名为HIV-1组M的亚组。自艾滋病大流行开始以来，已有超过3200万人死于艾滋病，这是一种由艾滋病毒引起的疾病。

从HIV-1在人类中开始传播到病毒的发现之间至少有80年的时间，这种疾病的大部分早期动态仍然是个谜。病毒变异率的数学模型暗示了HIV最初开始在人与人之间传播的时间，传播最终会转变为大流行。但一个很大的问题是，什么时候以及为什么HIV-1 M组变得如此成功，感染了足够有效的人，以至于可以走向全球。

Gryseels说，部分问题是近年来在计算病毒变化率方面做得很好的模型在较长的时间范围内变得不那么可靠。这在一定程度上是因为遗传信息会随着时间的推移而丢失：菌株由于自然选择或单纯的运气而灭绝，在目前流行的病毒基因组上没有留下它们存在的痕迹。

因此，对于古生物学家来说，发现一种古老的病毒株有点像发现始祖鸟。它是拼图中缺失的一块，有助于填补进化变革的血统。

格里塞尔加入了由亚利桑那大学进化生物学家迈克尔·沃奥贝领导的一个正在进行的项目，并与比利时、美国和刚果民主共和国的其他同事一起，分析了1958年至1966年期间在中非收集的1645份活检样本，目的是诊断医疗状况。活检组织保存在化学福尔马林中，然后包埋在石蜡中。研究人员使用非常灵敏的PCR方法(类似于在鼻咽部拭子中检测新型冠状病毒SARS-CoV-2的方法)，寻找HIV基因组的线索。他们只发现了一个：一名38岁男子的淋巴结活检序列。

还有更古老的艾滋病病毒片段，一个来自1959年，另一个来自1960年，也来自刚果民主共和国。但这些片段并不完整，因此不能提供关于病毒变异的那么多信息。Gryseels说，这些片段也来自不同的HIV亚型，这表明该病毒在20世纪50年代之前已经在人类体内传播了一段时间。

Gryseels说，研究人员将继续在很久以前的组织样本中寻找古老的HIV基因组。她说，理想的做法是找到更多20世纪50年代或60年代的样本来证实结果。下一个目标是找出HIV-1何时转变为加速流行的病毒。Gryseels说，有可能是HIV-1基因组中的某些变化使其更有效，但更有可能的是社会变化造成了不同。20世纪初，中部非洲的城市化发展迅速。在20世纪10年代至50年代之间，美国的公共卫生运动扩大了从昏睡病到疟疾和梅毒等疾病的治疗范围。但这些运动中的许多都没有对针头进行适当的消毒，这可能会广泛传播艾滋病病毒。20世纪60年代的非殖民化也可能导致人们四处走动或行为方式不同，这可能有助于病毒传播到新的人口中或更快地传播。

格里塞尔说：如果我们对这种扩张发生的时间线有了更好的了解，我们就能更有效地权衡这些不同的假设，因为它们发生的时间不同。

研究人员于5月19日在“美国国家科学院院刊”上发表了他们的发现。

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如果我没记错的话，最古老的VIH病例之一是一名斯堪的纳维亚水手，他经常去非洲的赤道地区旅行，后来死于艾滋病，他的妻子和女儿也是如此，那是在40多岁。经冰冻血检测，证实VIH具有传染性。我说的对吗？祝福+。

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