科学家寻找Covid-19的起源发现早期病毒序列中华民队从NIH数据库删除

在一个世界饥饿的世界中，有助于澄清Covid-19大流行的起源，声称有故意隐藏的SARS-COV-2的出土的早期序列的研究必将点燃炙手可热的辩论。由Fred Hutchinson Cancer Research Center的进化生物学家Jesse Bloom的未经推荐的论文断言，中国研究人员的一支来自中国武汉最早的Covid-19患者的病毒，将病毒序列发布到广泛使用的美国数据库中然后几个月后，遗传信息被删除为“模糊他们的存在”。

对于一些科学家来说，索赔强化了中国有一些东西隐藏大流行的起源。但是批评者的预印刷品，昨天发布了Biorxiv，说盛开的侦探工作就是ado，因为中国科学家后来以不同的形式发表了病毒信息，而恢复的序列很少地为SARS-COV-2的了解没有起源。

盛开的序列表示，尽管有大流行没有源于武汉的环华海鲜市场，但SARS-COV-2最初来到光明。 2019年12月31日中国卫生官员将市场与“未解释的肺炎”爆发联系起来，但一个月后，很明显，许多最早的案例没有与该地点的联系。本文突出了三种突变，从与市场相关的患者中收集的SARS-COV-2中发现的三种突变，这些突出症是冠状病毒的出土序列或其最近的亲密，2013年在蝙蝠发现的武汉病毒学研究所研究人员。

中国研究人员删除了数据的绽放更爆炸性断言必然会加剧关于病毒最初从未知动物跳过的人类的辩论，还是以某种方式从实验室泄漏。绽放表示，他对SARS-COV-2的特定起源假设没有偏见，他同意他突出的病毒序列是一小块一个大型未完成的拼图。 “我不认为这个悬而不见的是实验室的起源或人群神病，”他说。 “我认为它提供了额外的证据表明这种病毒可能在12月之前在武汉在武汉传播，当然，这可能是早期病毒序列的完整画面。”

盛开的，谁研究病毒进化，在举行的关于World Health组织（Who）组织的中外研究人员联合委员会的争议报告后启动了他的研究。 Bloom帮助组织了一个由17名其他科学家合作的讨论的讨论的信，批评了世界卫生组织的报告，以认为SARS-COV-2从实验室逃脱了“极不可能”。在第14届在科学中发布的信中，作者认为“在这种艰难但重要的问题上基于透露基于科学的话语”。

世卫组织报告严重依赖于Covid-19患者中发现的SARS-COV-2序列，绽放票据。 “我只是经历并试图在中国报告中重复一些分析，”布隆说。这使他参加了一项研究，列出了2020年3月31日之前提交的所有SARS-COV-2序列到序列读取档案（SRA），该数据库由国家生物技术信息中心监督，是美国国家卫生研究院的一部（ NIH）。但是当他检查了SRA的列出的项目之一时，他找不到它的序列。

谷谷谷谷谷谷歌唱了一些项目，他发现了另一个研究，由武汉大学的人民医院明亮，被称为早在Medrxiv的3月6日的预印刷品，并于6月24日发表于6月24日，众所周知，一项众所周知和化学比病毒学。该纸张列出了一些最早的武汉Covid-19患者和病毒中的特定突变，但没有提供完整的序列数据。进一步的Internet Sleuthing LED绽放，发现​​SRA在谷歌的云平台中备份其信息，并在那里搜索包含一些王赛中先的数据提交的文件。

小的论文没有提到对病毒序列的任何矫正都可以解释为什么他们从SRA中删除，这导致盛开的盛开在他的预印度中得出结论，“科学的信任结构被滥用，以滥用与早期传播相关的序列。 SARS-COV-2在武汉。“ Bloom断言，因为删除的序列缺乏来自海鲜市场的SARS-COV-2中看到的三个突变，因此王的团队的病毒发现更可能代表祖先。

但2013年发现的蝙蝠病毒的顺序不同于SARS-COV-2到约1100个核苷酸，这意味着几十年必须在进化到大流行冠状病毒之前，并且其他物种可能已经感染了它之前的蝙蝠病毒最后跳入了人。在爱丁堡大学的进化生物学家安德鲁·兰德尔德说，这意味着研究人员不能使用像盛开的亮点，以便及时回顾一些突出，看看SARS-COV-2家族树的“根”树。

绽放说他联系了中国研究人员，要求为什么他们删除了SRA数据，但他们没有回复。 （科学也没有在电子邮件发送引导作者后收到的答复。）NIH今天发表声明说，它在提交调查员的要求下删除了序列，该机构表示持有数据的权利。科学家“指出了序列信息已经更新，正在提交给另一个数据库，并希望从SRA中删除的数据来避免版本控制问题，”NIH说（布卢姆说他无法在他知道的任何其他病毒学数据库中找到序列。 ）

研究人员对盛开的SRA数据复活的价值大幅分开。 “这是调查SARS-COV-2的出处的创造性和严格的方法，”哥伦比亚大学邮递员公共卫生学院的微生物学家Ian Lizkin说。 “这两个家庭点是病毒在与武汉海鲜市场相关联的爆发之前循环，并且可能存在追踪其起源所需的流行病学和序列数据的积极抑制。”

撇开发现序列的含义盛开，研究人员可以在云中找到“新”数据的示范是一个令人兴奋的进展，增加了寺庙大学的基因组学研究并发表了对早期的SARS的分析 - COV-2序列，“很多人都觉得那里有更多的中国数据，他们没有进入它，”他说。

其他人受到了很多。 “Jesse正在重新铺设一年多的信息，并声称它证明了一个掩护，”犹他大学的演化病毒学家斯蒂芬戈德斯坦说。 “我不明白[他的推理]。”小篇论文只是一个很好的研究，“不幸的是飞到雷达以下”，他补充道。

Rambaut注意到中国研究人员在请求SRA删除数据之前提交了他们的小篇论文。 “这个小组试图隐藏一些东西的想法是游真的，”兰布说。 “如果他们覆盖了一些[Up]，他们肯定不会提交本文。 ......我不喜欢关于[盛开]的渎职的暗示，其中[绽放]有零知识的作者对文件的作者来删除其数据。“

来自伊拉斯斯大学医疗中心的世界卫生组织的成员，Marion Koopmans指出，其报告强调需要了解有关最早的流通病毒的数据。 “很高兴看到额外的数据，但我不确定这是什么意思，”Koopmans说，增加了预印的指控可能会伤害与中国研究人员的原籍研究的未来合作。 “介绍的语气在我看来，相当暗示，我希望科学将远离这一点。”

Bloom承认，研究人员可以将冠状病毒序列从小纸上发现的数据一起划分，但他说这不是现场对SARS-COV-2进行进化分析的方式。 “没有人知道这些序列，因为人们找到序列的方式是转到序列数据库并下载序列并查看它们，”布卢姆说。

他承认，踏入SARS-COV-2的分裂讨论，以价格为例。 “那么很多人都有关于这个话题的议程和先入为主的概念，如果你在这个话题上张开嘴，那么有人＆＃39; ve＆＃39; vers＆＃39; ve所说的，支持或拒绝一些特殊的叙述。” “所以选择根本不说什么，我不想＆＃39; t思想是有用或富有成效的，或者只是试图得出你可以的结论，并使它尽可能透明。无论多么多人喜欢[我的新学习]或者不是喜欢它，或者同意解释或不同意解释，他们至少可以下载它并自己重复。“