植物标本馆将 300 万份标本数字化,现在可在线免费获取

2021-07-25 21:54:01

分布在美国东南部的 100 多个植物标本馆网络最近完成了一项艰巨的任务,即将植物学家和博物学家在 200 年的时间里收集的超过 300 万个标本完全数字化。该项目由美国国家科学基金会资助,是世界各地自然历史机构正在进行的更大范围的持续努力的一部分,目的是让研究广泛的进化、灭绝、范围变化和气候变化模式的研究人员能够轻松获取他们的生物收藏。在发表在《植物科学应用》杂志上的一项新研究中,参与该项目的研究人员分析了可以可靠地拍摄、数字化和数据库化的速度,以评估未来类似的努力可能会花费多少。 “对此感兴趣的每个人都很早就意识到我们谈论的劳动力和金钱有多少,”资深作者、田纳西大学查塔努加分校生物学副教授兼植物标本馆馆长乔伊·肖说。 Shaw 指出,尽管自世纪之交以来,大型机构一直在进行数字化工作,但迄今为止,还没有人制定出一个强大的框架来确定将一组馆藏带到网上的成本。 “没有人真正以任何规模进行过研究,以了解每分钟可以编录多少标本。”对于依赖越来越少的行政资金来维护其馆藏的小型机构而言,此类信息可能至关重要。在大学和文理学院,这些努力也严重依赖于学生,他们为大学研究学分或作为雇员进行工作,这带来了一系列相关的好处和陷阱。数字化标本通常是学生对自然历史的第一次直接体验,并且对许多人来说,它会成为对生物学的终生欣赏。对于某些人来说,正如该研究的四位作者的情况一样,这种欣赏后来在研究生学习和自然科学领域的职业生涯中达到顶峰。然而,学生就业本质上是短暂的,在学生毕业或转到其他项目时,用于培训学生的资源通常会重复。因此,在项目构思之初,Shaw 和他的同事希望将与学生培训相关的滞后以及随着学生获得经验而随后生产力的提高纳入他们的分析中。

由此产生的估计非常精确,以至于 Shaw 和他的同事可以通过分析样本照片的上传率来准确确定课程何时放学。肖说:“学生们最终变得如此高效,以至于当课程放假、拿起手机的人数激增时,计算机和互联网的速度实际上开始减慢进程。”现在有成千上万的标本可以在线免费访问,Shaw 希望他​​们的数据能够帮助其他植物标本馆的工作人员了解他们的结果。本研究中的所有合作机构都是东南地区专业知识和收藏网络 (SERNEC) 的成员,该网络支持该地区的 200 多个植物标本馆,这些标本馆共容纳 1500 万个标本,其中大部分尚未数字化。随着城市化和森林砍伐导致栖息地丧失的数量不断增加,植物标本馆为研究人员提供了一个了解长期开发或拆除的生态系统的宝贵窗口。许多收藏品包括现已在野外灭绝的标本,而其他收藏品则发现了全新的物种。随着全球平均气温持续上升,科学家们越来越多地利用植物标本收集数据来分析气候变化已经对植物群落产生的影响。 “至少从文艺复兴时期开始,生物学家就以生物标本的形式积累了来自世界各地的物种数据,我们今天继续这种做法,”肖说。 “我们最近的工作是将这些生物标本的数据转换成一个可免费访问的在线数据库。这将是地球生物多样性中最大的数据集,而我们才刚刚开始构思研究、保护和土地管理问题这将用这个数据库来回答。”更多信息:Caleb Powell 等人,估计植物标本馆标本数字化率:考虑人类经验,植物科学中的应用(2021 年)。 DOI:10.1002/aps3.11415